Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms