Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms