Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RPE65Q16518 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RPE65Q16518 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RPE65Q16518 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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