Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF56Q15929 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms