Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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