Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDCD11Q14690 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD11Q14690 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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