Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTR4Q13639 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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