Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms