Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
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