Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ITGADQ13349 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ITGADQ13349 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGADQ13349 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGADQ13349 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGADQ13349 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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