Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms