Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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