Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPN13Q12923 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PTPN13Q12923 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPN13Q12923 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPN13Q12923 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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