Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC20Q12834 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms