Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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