Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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