Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms