Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms