Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms