Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDR1Q08345 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms