Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DHX9Q08211 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms