Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALD1Q05682 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms