Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms