Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms