Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSG4Q00888 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms