Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFAMQ00059 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms