Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IRX6P78412 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX6P78412 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms