Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CACNG7P62955 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CACNG7P62955 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CACNG7P62955 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CACNG7P62955 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNG7P62955 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms