Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIK1P57059 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIK1P57059 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIK1P57059 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms