Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPTEP56180 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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