Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMARCA2P51531 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA2P51531 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms