Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCT3P49368 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCT3P49368 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms