Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
COPB2P35606 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPB2P35606 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPB2P35606 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPB2P35606 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms