Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
KDM5AP29375 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5AP29375 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms