Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRMP28827 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
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