Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP1P28562 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP1P28562 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms