Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms