Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA6P23229 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms