Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms