Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB3P16520 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB3P16520 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB3P16520 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB3P16520 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GNB3P16520 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB3P16520 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB3P16520 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB3P16520 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB3P16520 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB3P16520 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GNB3P16520 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms