Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM27P14373 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms