Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms