Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH1P12830 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms