Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms