Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI3P10071 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI3P10071 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms