Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms