Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA4O75676 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms