Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms