Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRY3O43610 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRY3O43610 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRY3O43610 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPRY3O43610 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms