Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms